Арсеньевская юннатка находится в Комсомольском квартале города Арсеньева по адресу: улица Советская, дом 39А. От автобусной остановки «25 лет Арсеньеву» до станции юных натуралистов 1000 метров. Ближайшие образовательные учреждения — это школа №4 и гимназия №7. Рядом со станцией находится парковка для автомобилей.
Территория станции юннатов занимает площадь 2,3 гектара.